为保证实验教学中心科学有效规范的运行，学校制定了一系列管理规章制度。其管理制度主要有（学校在2006年更名前为“中国民航学院”）：
n 中国民航学院实验教学基本要求（1996）
n 中国民航学院实习教学管理的规定（1997）
n 关于调整组建四个全院性实验中心和十八个综合教学实验室的通知 (1998)
n 中国民航学院技术安全工作管理办法（2000）
n 中国民航学院固定资产审计实施办法 (2004)
n 中国民航学院实验室建设项目验收办法(2005)
n 中国民航学院实验室建设指导委员会章程(2005)
n 中国民航学院仪器设备管理办法(2005)
n 中国民航学院仪器设备调拨实施细则(2005)
n 中国民航学院实验室管理规章制度(2005)
n 中国民航学院仪器设备损坏丢失赔偿细则(2005)
n 中国民航学院综合性设计性实验项目开发实施办法(2005)
n 中国民航学院仪器设备采购管理细则(2005)
n 中国民航学院实验室工作规定(2005)
n 中国民航学院仪器设备报废实施细则(2005)
n 中国民航学院教学仪器设备维修管理细则(2005)
n 中国民航学院大型贵重仪器设备管理实施细则(2005)
n 中国民航学院研制改造实验教学仪器设备管理办法(2005)
n 中国民航大学教学实验室设置(2008)
依据学校相关管理制度，中心制定了有关设备、资金、人员、质量保证等制度。
n 航空电子电气实验教学中心职工岗位考核办法
n 航空电子电气实验教学中心实验室开放管理细则
n 航空电子电气实验教学中心经费使用管理办法人员
n 航空电子电气实验教学中心人员岗位责任
