交通科学与工程学院是中国民航大学在建设“一流交通”学科大背景下于2021年新组建成立的二级学院。学院前身为1995年成立的航空港工程系。2002年，随着学校专业和院系调整，在航空港工程系的基础上组建交通工程学院。2010年4月23日，为满足民航机场建设需要，增强机场工程与运行等专门人才的培养能力，更名为机场学院，时任中国民航局局长李家祥专门为学院成立题词 “建设民航强国呼唤人才”。2021年3月，以机场学院、通用航空学院为基础，整合学校优势教学资源，组建交通科学与工程学院。学院主要围绕机场规划设计及运行、通航与低空规划与管理、无人机控制与运行保障、航空物流工程与管理、航空交通环境等领域开展科研及教学工作，是中国民用航空局“民用无人驾驶航空器操控员执照”考试点和中国航空运输协会“民用航空低空飞行服务专业人员基础”培训机构。
学院设有“交通与机场管理系”、“土木与机场工程系”、“航空物流系”、 “通航与低空工程系”四个系部；拥有“交通运输工程”一级学科博士学位授权点和“交通运输”博士专业学位授权点、“低空安全技术工程”二级学科博士学位授权点，拥有“交通运输工程”学术型硕士点和“交通运输-航空交通运输领域”专业型硕士点，“交通运输工程”软科排名21；设有“交通工程”（天津市一流本科专业）、“土木工程”（天津市一流本科专业）、“物流管理”、“无人机驾驶航空器系统工程”、“低空技术工程”（已公示）等本科专业。
学院拥有“民航机场工程科研基地”、“民航环境与可持续发展研究中心”、“天津市临空经济研究中心（智库）”、“天津市交通运输第一批新型智库”、“天津市通用航空研究中心（智库）”、“天津市城市空中交通系统技术与装备重点实验室”、“天津市民航能源环境与绿色发展工程研究中心”、“交通运输部综合交通运输理论行业重点实验室”以及“天津市机场工程实验教学示范中心”等科研平台及实验中心。
近年来，学院取得了丰硕的科研成果，先后承担国家自然科学基金项目、省部级科技攻关项目、民航局基金项目和各类横向项目等800余项，获得省部级科技成果一等奖、二等奖等60余项，取得国家专利350余项，出版专著与教材40余部，公开发表学术论文1900余篇，被SCI、EI、ISTP等检索论文400余篇，“十四五”实现成果转化50余项，转化金额近千万元。